「令和 7年　通勤手当に係る所得税の非課税限度額の改正」に伴う支払済みの課税通勤手当の精算前に年末調整の処理状況を「処理済」にした場合の対応を知りたい

［給料等調整入力］メニューで、改正前の非課税限度額で支払った通勤手当との差額を「非課税となる通勤手当」に入力します。

ただし、年末調整が処理済みの社員について「非課税となる通勤手当」を入力し、差額の反映を実行すると、 年末調整の処理状況が「処理中」になります。
計算後は、［年末調整処理］メニューで［F12：登録］を押し、処理状況を「処理済」にしてください。