月次減税で控除しきれない社員がいる場合は、どういう処理が必要ですか

月次減税で控除しきれなかった分は、年末調整で再計算し、残りの控除を行います。
具体的には、年末調整時に再度定額減税額を計算し、従来の年税額から控除します。もし年末調整でも控除しきれない場合は、その分は翌年に持ち越されることはなく、調整給付金として市区町村から支給されます。