賞与の支給が年 4 回以上あった場合は、算定基礎（月額変更）処理で自動的に金額が集計されますか

自動的に集計されません。
賞与が年 4 回以上支給される場合は、通常の報酬に含めます。
1 年間の賞与の合計額を 12 で割って1 ヵ月分を計算し、各月の「通貨による額」欄に直接入力して加算してください。
4 回目以降の賞与がその年に限り支給されたことが明らかな場合は、通常の賞与と同様に報酬に含める必要ありません。