通勤手当の差額を計算した場合に、過去月の給与データも変更されますか

［社員情報登録］メニューの［F6：通勤更新］

この機能は、これからはじめる給与処理について、改正後の「非課税通勤費」「課税通勤費」で処理を行うための機能です。
したがって、すでに処理済みの給与（賞与）データには影響しません。

［給料等調整入力］メニューの「通勤手当非課税調整額計算」

この機能は、支払済みの給与明細は変更せずに、自動計算した「改正後の非課税限度額にもとづく差額」を年末調整に反映し、精算するための機能です。
したがって、すでに処理済みの給与（賞与）データには影響しません。