［給料等調整入力］メニューで「給料・手当等」の非課税額欄にすでに金額が登録されている場合は、「令和 7年　通勤手当に係る所得税の非課税限度額の改正」にどのように対応すればよいですか

「給料・手当等」の非課税額欄にすでに金額がある状態で、［F6：通勤計算］を押して通勤手当計算を実行すると、「給料・手当等」の非課税額欄が「非課税となる通勤手当」の金額で上書きされます。

この場合は、［給料等調整入力］画面で該当社員の「給料・手当等」の非課税額欄に登録されている金額を、「その他」の非課税額欄に移してから、通勤手当計算を実行してください。
詳細は、ヘルプセンターの「通勤手当非課税限度額改正ガイド」をご参照ください。