国税庁の「通勤手当の非課税限度額の改正に関するQ＆A」に伴う追加対応と操作が知りたい

概要

令和 8年 4月の税制改正により、通勤のために自動車等の交通用具を使用している給与所得者に支給する通勤手当の非課税限度額について改正されました。
本改正に関して、国税庁より「通勤手当の非課税限度額の改正に関するQ＆A」が公開されました。
通勤手当の非課税限度額の改正について｜国税庁

これに伴い、当製品では、交通用具（マイカー等）で通勤し、かつ駐車場手当を支給している場合の非課税限度額について、具体的な計算方法に関する追加対応を行いました。

この追加対応により、下記「操作する必要性」に該当する社員については、通勤手当の設定の更新や、支給済みの課税通勤費の調整が必要となる場合があります。その場合の操作手順を説明します。ただし、該当する社員がいない場合は、以降の操作は不要です。

対応する計算方法

自動車等の交通用具を使用して通勤している場合に支給される通勤手当が、通勤距離に応じた非課税限度額を下回る場合の計算方法に対応しました。

計算例

• 片道距離：50 km
• 通勤距離に応じた通勤手当：28,000 円
• 駐車場等の料金相当額の通勤手当：8,000 円

合計 36,000 円を支給する場合

以下のように非課税限度額が計算されます。

1. 通勤距離に応じた非課税限度額：32,300 円（片道 45 km以上 55 km未満）
2. １ヵ月当たりの駐車場等の料金相当額：5,000 円（１ヵ月当たりの料金 8,000 円が 5,000 円を超えるため、5,000 円）
3. 非課税限度額：37,300 円（32,300 円＋5,000 円） 

支給額 36,000 円は、非課税限度額 37,300 円を下回るため、支給する通勤手当が全額非課税となります。

操作する必要性

以下のすべてに該当する社員がいる場合は、操作が必要です。

• 交通用具（マイカーなど）を使用して通勤している（［社員情報登録］メニューの［住民税・通勤手当］ページの通勤手当３を設定している）
• 駐車場手当を支給している（［社員情報登録］メニューの［住民税・通勤手当］ページの通勤手当３の「支給額（駐車場等）」を設定している）

操作手順

令和 8年 4月の給与処理の状況に応じて、対応する操作が異なります。
該当する社員がいる場合は、令和 8年 4月の給与処理の状況に応じて、以下の操作を行ってください。

すでに令和 8年 4月分の給与を支給済みの場合

社員情報の「通勤手当３」を今回の追加対応後の金額に更新したうえで、給与処理で支給済みの課税通勤費と非課税通勤費の差額を算出し、課税支給額を調整します。

現在の通勤手当の金額を汎用データで出力する

後述、「令和 8年 4月の給与処理で支給済みの課税通勤手当との差額を計算する」の手順で、現在の社員情報の通勤手当と今回の追加対応後の通勤手当を比較します。そのため、社員情報の「通勤手当３」を追加対応後の金額に更新する前に、以下の手順で汎用データを作成します。

1. ［随時処理 - 汎用データ作成 - 社員情報データ作成 - 社員情報データ作成］メニューを選択します。
2. ［社員情報データ作成 - 出力条件設定］画面で、以下のように設定します。
   • ［基本設定］ページ
     「退職社員を含めて作成する」にチェックを付けます。
   • ［出力設定］ページ
     ファイルの種類で、「Excelファイル」を選択します。
   • ［項目選択］ページ
     ［選択項目］リストから以下の項目を選択し、［選択済項目］リストに移動します。
     • 情報種類に「基本」を選択します。
       • 社員番号
       • 氏名
     • 情報種類に「通勤」を選択します。
       • 通勤手当３－支給間隔
       • 通勤手当３－支給方法
       • 通勤手当３－支給額
       • 通勤手当３－支給額（駐車場等）
       • 通勤手当３－非課税通勤費
       • 通勤手当３－課税通勤費
       • 通勤手当３－片道距離
3. ［出力開始］ボタンをクリックします。

社員情報の「通勤手当３」を今回の追加対応後の金額に更新する

社員情報の「通勤手当３」を今回の追加対応後の金額に更新します。
詳細は、ヘルプセンターの「令和 8年 4月通勤手当改正の制度概要と『給与奉行』の操作手順を知りたい」-「社員情報の「通勤手当３」を改正後の金額に更新する」をご確認ください。

令和 8年 4月の給与処理で支給済みの課税通勤手当との差額を計算する

支給間隔が「0：毎月」「1：２ヵ月」「2：３ヵ月」「3：６ヵ月」の場合

1. 「現在の通勤手当の金額を汎用データで出力する」と同じ手順で、今回の追加対応後の通勤手当の金額を汎用データで出力します。
2. 以下のすべてに該当する社員を抽出します。
   • 「通勤手当３－支給間隔」が「毎月」「２ヵ月」「３ヵ月」「６ヵ月」
   • 「通勤手当３－課税通勤費」が「1」以上 
3. 抽出した社員について、「現在の通勤手当の金額を汎用データで出力する」で出力した汎用データと、手順1. で出力した汎用データの通勤手当の金額を比較し、課税通勤費・非課税通勤費の差額を確認します。

支給間隔が「4：毎日」の場合

1. 「現在の通勤手当の金額を汎用データで出力する」と同じ手順で、今回の追加対応後の通勤手当の金額を汎用データで出力します。
2. 「通勤手当３－支給間隔」が「毎日」の社員を抽出します。
3. 「通勤手当３－支給額（駐車場等）」に令和 8年 4月の給与処理月の「出勤日数＋休出日数」を乗じ、駐車場手当を算出します（出勤日数および休出日数に 1日未満の端数がある場合は、それぞれ切り上げた日数で計算します）。
4. 算出した駐車場手当が、5,000 円を超える社員を抽出します。

5. 抽出した社員について、課税通勤費・非課税通勤費の差額を計算します。

   例	［社員情報登録］メニューの［住民税・通勤手当］ページ 通勤手当１   支給間隔 支給額 非課税通勤費 入力・設定値 毎月 10,000 円 10,000 円 通勤手当３   支給間隔 片道距離 支給額 支給額（駐車場等） 入力・設定値 毎日 10 km 400 円 1,000 円 ［給与処理］メニューの令和 8年 4月の給与データ   出勤日数＋休出日数 通勤手当 課税通勤手当 入力値 10 日 19,000 円 5,000 円

   1. 片道距離に応じた非課税限度額を確認します。
      通勤手当の非課税限度額の改正について｜国税庁

      片道距離が 10 kmの場合は、「7,300 円」が非課税限度額です。

   2. ［社員情報登録］メニューの［住民税・通勤手当］ページの通勤手当１または通勤手当２の非課税通勤費を確認します。

      通勤手当１で毎月「10,000円」通勤手当（非課税通勤費）を支給しています。

   3. 令和 8年 4月の給与データ入力画面に表示されている「通勤手当＋課税通勤手当」から、手順①と②の金額と 5,000 円（駐車場手当の非課税限度額）を差し引きます。

      以下のように差額を計算します。 （通勤手当＋課税通勤手当）－（手順①の金額＋手順②の金額＋5,000 円） ＝（19,000 円＋5,000 円）－（7,300 円＋10,000 円＋5,000 円） ＝1,700 円

   4. 4月の給与データ入力画面に表示されている課税通勤手当から、手順③の金額を差し引き、課税通勤手当の差額を算出します。

      4月の給与データ入力画面に表示されている課税通勤手当－手順③の金額 ＝5,000 円－1,700 円 ＝3,300 円   4月の給与処理（現在の金額） 今回の追加対応後の金額 差額 通勤手当 19,000 円 22,300 円 －3,300 円 課税通勤手当   5,000 円   1,700 円    3,300 円

       

      補足	今回の追加対応後の非課税限度額（手順①の金額＋手順②の金額＋5,000 円）が、4月の給与データ入力画面に表示されている「通勤手当＋課税通勤手当」を上回った場合は、4月の給与データ入力画面に表示されている課税通勤手当の金額が、課税通勤手当の差額になります。

課税支給額を調整する

令和 8年 5月の給与処理で課税支給額を調整する場合

令和 8年 5月の給与処理で、「課税通勤手当」と「通勤手当」に差額を以下のように入力します。

• 課税通勤手当
  現在の課税通勤手当から、差額を差し引いた金額を入力します。
• 通勤手当
  現在の通勤手当に、差額を加算した金額を入力します。

例	課税通勤手当の差額が、3,300 円の場合

年末調整処理で課税支給額を調整する場合

1. ［年末調整 - 給料等調整入力 - 給料等調整入力］メニューを選択します。

2. 【給料・賞与等調整情報】の非課税額欄に、差額を入力します。

   例	課税通勤手当の差額が、3,300 円の場合

3. ［F12：登録］を押します。

まだ令和 8年 4月の給与処理を開始していない場合

社員情報の「通勤手当３」を今回の追加対応後の金額に更新します。
詳細は、ヘルプセンターの「令和 8年 4月通勤手当改正の制度概要と『給与奉行』の操作手順を知りたい」-「社員情報の「通勤手当３」を改正後の金額に更新する」をご確認ください。

令和 8年 4月の給与処理は完了しているが、まだ支給していない場合

社員情報の「通勤手当３」を今回の追加対応後の金額に更新する

社員情報の「通勤手当３」を今回の追加対応後の金額に更新します。
詳細は、ヘルプセンターの「令和 8年 4月通勤手当改正の制度概要と『給与奉行』の操作手順を知りたい」-「社員情報の「通勤手当３」を改正後の金額に更新する」をご確認ください。

給与処理を再計算する

対象の社員の令和 8年 4月の給与処理を再計算します。
詳細は、ヘルプセンターの「給与（賞与）データを再計算する」をご参照ください。