生命保険の契約者が従業員本人でない場合に、生命保険料控除の特例が適用されるかを知りたい

生命保険の契約者が従業員本人である必要はありません。
従業員本人が保険料を支払い、保険金の受取人が本人・配偶者・その他の親族であれば、生命保険料控除の特例の対象となります。